Aburame Clan
Bilinen Üyeler: Aburame Shino, Aburame Shibi
Bilinen Yetenek: Kikaichuu no Jutsu
Gizli Yaprak Köyünden Aburame Klanı böceklerle olan bağları ile tanınır. Doğumda klan üyeleri böceklerle bir anlaşma yaparlar. Böcekler onların vücutlarında yerleşip çakraları ile beslenecektir. Karşılığında böcekler klan üyelerinin emirlerini yerine getirmektedirler.
Akimichi Klanı
Bilinen Üyeler: Akimichi Choji, Akimichi Chouza
Özel Yetenek: Baika no Jutsu
Vücutlarının büyüklüğünü değştirebilmektedirler.
Haku
Gizli
Köy: Sis
Bilinen Üyeler: Haku ve annesi
Özel Yetenek: Makyou Hyoushou
Suyu buz haline dönüştürme yeteneğine sahiptir.
Hyuuga Klanı
Gizli Köy: Yaprak
Bilinen Üyeler: Neji, Hinata, Hizashi, Hiashi, Hanabi
Özel Yetenek: Byakugan
Beyaz Göz, Şeytani Göz anlamına gelen Byakugan göz tekniğine sahiptir. Bu
özellikle vücuttaki çakra yollarını görebilmektedirler. Taijutsu ile
birleştirilen byakugan düşmanlarının çakra yollarını kapatarak onları etkisiz
kılar. Aynı zamanda bu göz tekniği hemen hemen 360 derece ve 5 metre ve üstü
uzak mesafeyi görme yeteneğine sahiptir.
Inuzuka Klanı
Gizli
Köy: Yaprak
Bilinen Üyeler: Kiba, Tsume, Hana
Özel Yetenek: Shikyaku no Jutsu
Köpek ve benzeri hayvanlarla bağlantılı bir klandır. Dövüş tekniklerinde
köpekleri kullanırlar. Burunları da bir köpeğinki kadar keskindir. Kendilerine
köpek özellikleri veren ya da köpekleri ile ortak tekniklere sahiptirler.
Kaguya Klanı
Bilinen Üyeler: Kaguya Kimimaro
Özel Yetenek: Shikotsu Myaku
Dövüşmeyi seven bu klan kendi köylerine saldırmışlar ve Kimimaro dışında hepsi öldürülmüştür. İskelet yapısını istedikleri gibi kontrol etme yeteneğine sahiptirler. Vücutlarındaki bir kemiği çıkarıp silah olarak kullanabilirler ve yeni kemik yapma özelliğine sahiptirler.
Nara Klanı
Gizli
Köy: Yaprak
Bilinen Üyeler: Shikamaru, Shikaku, Yoshino
Özel Yetenek: Kagemane no Jutsu, Kage Kubi Shibari no Jutsu
Gölgeleri kullanma yeteneğine sahiptirler. Kendi gölgesini bir başkasınınki ile
birleştirerek o kişinin vücudunun kontrolünü ele geçirebilir, onları hareketsiz
kılabilirler.
Sakon ve Ukon
Gizli Köy: Ses
Bilinen Üyeler: Sakon, Ukon
Özel Yetenek: Souma no Kou
Vücut hücrelerini istedikleri gibi kullanırlar. Ukon ve sakon bir vücudu paylaşırlar ama istedikleri zaman birbirlerinden ayrılabilirler. Lanetli mührün de yardımı ile Ukon kendisni bir başkasının vücudunun içine sokup onu ele geçirebilmektedir.
Senju Klanı
Bilinen Üyeler: Shodai Hokage, Nidaime Hokage, Tsunade
Senju (Bin Kol) Konoha köyünü kuran klanlardan birisidir. Birinci Hokage Shodai'nin yönetiminde Uchiha gibi diğer klanlarla birleşerek Gizli Yaprak Köyünü kurarlar.
Uchiha Klanı
Bilinen Üyeler: Sasuke, Itachi, Obito, Madara...vb
Özel Yetenek: Sharingan
Sharingan adlı özel bir göz yeteneğine sahip klan genjutsu tekniklerinde uzmandır. Bu göz tekniği ile ayrıca teknikleri kopyalayabilirler ve çevrelerindeki hareketi yavaş çekimdeymiş gibi görüp rakiplerinden daha hızlı hareket edebilirler.